El Colegio Salesiano Padre José Fernández Pérez surge de la unión de dos instituciones educativas prestigiosas ubicadas en la población Techo para Todos, sector populoso de la ciudad de Puerto Montt.
Ella se remonta al 1° de marzo de 1962, fecha en que el espíritu pedagógico del P.José Fernández Pérez, con su vocación de enseñar a niños y jóvenes, lo llevó ese año a hacer funcionar la Escuela Particular Cristo Salvador.
El rol que cumplía la escuela era el de satisfacer la necesidad de educación que tenían los hijos de los pobladores del lugar, afectados por el terremoto de 1960.
El sacerdote no sólo deseaba que estos niños tuvieran una enseñanza básica sino también la enseñanza media y más aún aprender un oficio que los ayudara a desenvolverse en el medio laboral, surgiendo así la escuela técnica Laura Vicuña.
En el año 1969 la administración de la Escuela Cristo Salvador, es asumida por las Religiosas del Sagrado Corazón, quienes consolidaron la labor realizada por los profesores pioneros.
El P.Fernández en su incansable trabajo sentía que faltaba tener un Liceo, es por ello que luego de varias gestiones y contando con el apoyo de la Cooperativa Fe, Unión y Esfuerzo, surge la idea de formar un colegio. Así en 1981 nace el Liceo Peñihue, que en mapudungun significa "Comunidad de hermanos".
Desde que el P.Fernández comenzó a resentir su estado de salud se dio cuenta que para poder dar continuidad a su obra educativa, era necesario llamar a la Congregación Salesiana, para que ésta continuara su obra soñada, principalmente por la necesidad de dar a la juventud una educación integral, todo esto bajo el alero de un padre bondadoso y carismático, como lo es San Juan Bosco.
Gracias a la intervención oficial del Arzobispo Monseñor Eladio Vicuña, el 6 de febrero de 1986, los Padres Salesianos se hacen cargo del Liceo Peñihue y el 15 de diciembre el mismo año, se autoriza la constitución canónica de la comunidad salesiana en Puerto Montt, en el sector de la población Techo para Todos.
En el año 1992, el Liceo Peñihue pasa a convertirse en Liceo Politécnico Salesiano al ser incorporadas las carreras técnicas de Contabilidad y Electricidad.
El 12 de junio del año 2000, el Presidente de la Cooperativa Fe, Unión y Esfuerzo y el Inspector de la Congregación Salesiana firmaron un acta que traspasó el Liceo Politécnico Salesiano a la Congregación Salesiana junto con la tuición de la Escuela Cristo Salvador.
A partir del año 2003, los establecimientos educacionales fundados por el P. José Fernández Pérez (Escuela Cristo Salvador y Liceo Politécnico Salesiano) conformarán el Colegio Salesiano Padre José Fernández Pérez, que contemplará su enseñanza desde Prebásica hasta Cuarto año Medio.
Consecuente con el Proyecto Educativo Pastoral Salesiano de la Congregación en Chile, el Colegio Salesiano de Puerto Montt intenciona su acción para formar a los (las) jóvenes con propuestas educativas integrales, fieles al ideal de Don Bosco: "Formar honrados ciudadanos y buenos cristianos".

La Parroquia fue creada en el año 1959, con el nombre de San Antonio de Padua. En el año 1960, después del terremoto el Padre José Fernández Pérez, construyó el Templo Cristo Salvador y tomó posesión de la Parroquia, fundando además la Población Techo para Todos, la Octava Compañía de Bomberos, el Centro de Salud Familiar, el Liceo Peñihue y la Corporación Fe, Unión y Esfuerzo.

La Congregación Salesiana se hizo cargo de la obra del Padre Fernández, siendo el P.Pepe Forbes, el primer sacerdote salesiano que llegó a la ciudad en el año 1981. Posteriormente en el año 2008, se realizó el cambio de nombre, llamándose desde entonces Parroquia Cristo Salvador, que reúne a cinco comunidades de base: San Antonio de Bellavista, Laura Vicuña, San Alberto de Crucero, San Sebastián de Cardonal y la sede que lleva el mismo nombre.